結核菌の薬剤耐性、DNA配列決定で予測

DNA塩基配列決定による第1選択抗結核薬の感受性プロファイル予測能を検討。6大陸16カ国の結核菌分離株1万209株の全ゲノム配列および薬剤抵抗性および感受性の表現型データを用いた。 その結果、薬剤抵抗性はイソニアジド97.1％、リファンピシン97.5％、エタンブトール94.6％、ピラジナミド91.3％の感度で、薬剤感受性はそれぞれ99.0％、98.8％、93.6％、96.8％の特異度で正確に予測した。薬剤感受性の完全な表現型プロファイルが得られた5865株のうち、89.5％のプロファイルを正確に予測した。...